據《長江“三磷”專項排查整治行動實施方案》(以下簡稱《實施方案》)，生態環境部組織長江經濟帶7省(市)開展為期兩年的排查整治工作，目前地方自查已全面結束。從自查情況看，湖北、貴州、云南、四川、湖南、重慶、江蘇等7省市聚集了全國60%以上的涉磷企業，“三磷”企業(礦、庫)數量高達692家(個)，其中磷礦229個、磷肥企業252家、含磷農藥企業29家、黃磷企業85家、磷石膏庫97個。

排查發現，磷石膏庫問題最為突出，53.61%的磷石膏庫存在環境問題;其次是磷肥企業，問題率高達47.62%;黃磷和含磷農藥企業存在問題比例分別為42.35%和34.48%;磷礦問題率相對較低，也達25.33%。

生態環境部表示，為妥善解決“三磷”企業存在的生態環境問題，針對磷礦、磷肥、含磷農藥、黃磷和磷石膏庫5類重點，按照《實施方案》提出的“三個一批”要求，即以飲用水源地等敏感水體以及人口密集區為重點，以符合行業政策為基準，依法律法規關停取締一批，消除“三磷”行業重大環境風險;以實現達標排放和解決生態環境突出問題為核心，整治規范一批，提高全行業環境管理水平;以推動行業清潔生產和技術進步為導向，改造提升一批，促進行業轉型升級，分別明確關停取締要求、規范整治要求和提升改造要求，以及企業各產污治污環節的整治要點等。